El 19 de octubre de 2011 se conoció la propuesta de trazados del Ministerio de Fomento para incluir en la Red Transeuropea de Transportes. En materia ferroviaria, el trazado por La Rioja, que se encuentra inscrito en la planificación ferroviaria española en el llamado Corredor Cantábrico-Mediterráneo de Altas Prestaciones, quedaba manifiestamente en desventaja respecto a otras partes del trazado del misno corredor.
Tanto en las áreas de pasajeros como de mercancías, el trazado Castejón-Logroño quedaba inlcuido en el apartado de Red Global mientras que los trazados aragonés, vasco y navarro del mismo corredor eran incluidos en el apartado de Red Básica.
Esta decisión de Fomento, desconocida por el Gobierno de La Rioja hasta ese momento, chocaba con todas las planificaciones realizadas hasta el momento en materia ferroviaria y rompía el compromiso adquirido de impulsar los tramos de La Rioja en las mismas condiciones que el resto del corredor.
El Gobierno de La Rioja mostró su crítica y descontento y aprobó una Declaración Institucional en la que se instaba al Gobierno central a que rectificara esa propuesta y defendiera ante las instituciones europeas la inclusión del trazado ferroviario de alta velocidad en el Corredor Cantábrico-Mediterráneo a su paso por La Rioja, y que fue apoyada por los agentes económicos y sociales más representativos.
El 15 de febrero de 2012, el Ministerio de Fomento presentó una nueva propuesta para el desarrollo de la Red Transeuropea de Transportes que al incluir la "conexión Bilbao-Zaragoza por Vitoria-Logroño además de por Pamplona" (mapas) y que situaba a las infraestructuras de La Rioja en igualdad de condiciones que las comunidades autónomas vecinas.
Según el nuevo planteamiento de Fomento presentado por la Ministra Ana Pastor y que sustituía al de octubre de 2011 el tramo comprendido entre Castejón y Miranda de Ebro se incluye en la red básica transeuropea tanto de transporte de mercancías como de viajeros.
► Mapas propuesta octubre 2011 / febrero 2012(ppt)
Por su parte, el Gobierno de La Rioja presentó en marzo de 2012 el informe "El papel de la Rioja en la futura red ferroviaria traseuropea de transporte", elaborado por la Fundación Caminos de Hierro bajo la dirección del investigador Eduardo Romo. A lo largo de 60 páginas, esgrime once razones técnicas para demostrar la idoneidad del trazado riojano dentro del mapa ferroviario europeo que se define en la Red Transeuropea de Transporte.
El 22 de marzo de 2012 el Consejo de Ministros de Transportes de la UE rechazó la propuesta española de febrero de 2012 dando por buena la de octubre de 2011. El Gobierno de La Rioja inician una serie de contactos para defender los intereses de La Rioja.
En junio de 2013, el Consejo de Ministros de la UE acepta la creación de un nuevo fondo para la financiación de actuaciones necesarias para la integración de los corredores principales aceptando la propuesta española de incluir determinadas conexiones entre corredores (Pamplona-Corredor Atlántico, Sevilla-Huelva y el corredor riojano Castejón-Logroño-Miranda) entre las actuaciones con financiación prioritaria de la UE.
El Pleno del Parlamento Europeo celebrado el 19 de noviembre de 2013 aprobó la posibilidad de que determinados tramos ferroviarios no incluidos en la red básica puedan acceder a financiación europea en la medida en que sirvan de conexión de dos corredores principales, vía por la que Fomento incluyó en su propuesta la redacción de los proyectos del tramo Castejón-Logroño-Miranda de Ebro (incluida la construcción de la variante de Rincón de Soto) al amparo de la convocatoria 2014.
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