El incremento de los fondos de la Biblioteca se realiza habitualmente por medio de las publicaciones propias y a través del intercambio de las publicaciones del IER con otros organismos. Los fondos también se incrementan, como ya hemos mencionado, por adquisiciones o por donaciones institucionales o de particulares.
El fondo moderno comprende el conjunto de documentos posteriores a 1901, editados sobre cualquier tipo de soporte, que se puede consultar en el catálogo en línea de la Biblioteca de La Rioja. Los registros aportados hasta hoy desde el IER a la base de datos de la red, ascienden a 19.890 volúmenes. Entre los cuales se pueden incluir una buena parte de los siguientes: