El Instituto de Estudios Riojanos tiene entre sus objetivos promover la investigación sobre temas riojanos y apoyar la labor de los investigadores en estos temas.
Las Áreas de Investigación son los órganos encargados de la realización de los trabajos propios del IER, bajo la responsabilidad de un director. Así, las Áreas de Investigación atienden a la financiación, publicación de los trabajos y coordinación de la labor de los científicos y equipos correspondientes (Investigadores Agregados).